Pretty microRNA (for a White Guy)

Не всі люди є шанувальниками панк-року, і не всім ім'я «Декстер Холланд» про що-небудь говорить, але уникнути в кінці дев'яностих пісні «Pretty fly (for a White Guy)» групи «The Offspring» не вдалося практично нікому. Продажі альбомів групи на даний момент досягли 50 мільйонів примірників - це одна з найбільш комерційно успішних панк-рок груп в історії музики. Тут доречно запитати, до чого це ми, взагалі, згадали The Offspring і до чого тут наука? Зараз пояснимо, привід дійсно є.


Соліста гурту насправді звуть не Декстер, а Браян Кіт Холланд, зараз йому 51 рік, і крім музики він займається різними речами: збирає марки, бігає марафони, є професійним пілотом і за десять днів здійснив навколосвітню подорож, а компанія продає гострий соус «Gringo Bandito», перші порції якого він роздавав друзям і родичам. На сьогоднішній день Холланд продав вже багато мільйонів пляшок цього соусу, і він входить в десятку кращих приправ згідно з рейтингом користувачів найбільшої фірми доставки товарів Amazon.


Справа в тому, що Декстер крім іншого займається ще й молекулярною біологією. І ось, минулого тижня він повідомив у твіттері, що нарешті захистив за цією спеціальністю дисертацію, написання якої так довго відкладав через щільний графік концертних турів. Текст роботи становить понад сто п'ятдесят сторінок і називається "Відкриття зрілих мікроРНК-подібних послідовностей, вбудованих у білок-кодуючі області геномів вірусу імунодефіциту людини HIV-1: передбачення нових механімів вірусної інфекції та патогенності ". Прочитати її можна тут. І якщо з приводу музики Декстера є різні думки, то його наукова робота, безумовно, заслуговує на увагу.

У роботі описано цікавий феномен: виявляється, віруси імунодефіциту іноді містять у своєму геномі копії мікроРНК людини. МікроРНК - це некодуючі ланцюжки РНК довжиною в 17-24 нуклеотиди, які в точності комплементарні певним ділянкам кодуючих РНК (розташованих в їх нетранслованій області 3'-UTR). Зв'язуючись з ними, мікроРНК здатні брати участь у регуляції синтезу білка, наприклад, блокуючи його. Такий механізм регуляції, як стало зрозуміло в останні роки, поширений серед величезної кількості клітинних процесів, починаючи від ембріонального розвитку і закінчуючи диференціацією клітин дорослого організму - і порушення його можуть призводити, як з'ясувалося, до самих різних захворювань, в тому числі, і до розвитку раку.

Холланд описує низку випадків, коли віруси імуннодефіциту людини містять у своїй РНК точні послідовності різних мікроРНК людини. На основі даних метагеноміки з'ясувалося, що принаймні вісім мікроРНК людини, мабуть, беруть участь у процесах, хід яких порушується при інфекції ВІЛ. Послідовності п'яти з таких мікроРНК при цьому виявилися в геномах різних штамів цього вірусу. Така мімікрія, вважають Холланд і його колеги, дозволяє вірусам якимось чином запобігати імунній відповіді організму і успішно існувати в ньому, не піддаючись знищенню.

Робота повністю біоінформатична: очевидно, музикант більше цікавився комп'ютерною обробкою даних і передбаченнями, зробленими на її основі, ніж «мокрою» роботою в лабораторії. Крім того, у нього просто могло не бути на це часу, тоді як для біоінформатичних проектів часто достатньо звичайного ноутбука.

Холланд присвятив свою дисертацію своїй дружині Ембер і двом іншим «дівчаткам» свого життя, Зої і Лейле. Вона написана прекрасною і зрозумілою мовою, і в передмові вона багато дякує своїм науковим керівникам, які взяли його в лабораторію після довгої перерви і дозволили йому завершити цей проект, незважаючи на важкий і часом непередбачуваний робочий графік музиканта.

"Моя робота - не розробка ліків від СНІДу, вона навіть не відноситься безпосередньо до медицини, але мені здається дуже важливим намагатися зрозуміти якомога більше про саму природу ВІЛ. За останні тридцять років ми накопичили про неї чимало даних, і з часом це допоможе нам перемогти цей вірус. Я буду продовжувати займатися своїми дослідженнями і, напевно, ви будете періодично бачити мої публікації в цій області ".


COM_SPPAGEBUILDER_NO_ITEMS_FOUND