Вірус свинячого грипу назвали загрозою нової пандемії
З 2016 року у домашніх свиней в Китаї домінує вірус грипу, геном якого поєднує ознаки штамів вірусу свинячого грипу H1N1, які викликали пандемію 2009 року, і північноамериканського реассортантного (що поєднує в собі гени відразу декількох різновидів вірусу) штаму, повідомляється в. Лабораторні дослідження показали, що він дуже легко заселяє клітини епітелію дихальних шляхів людини, а понад 10 відсотків працівників свиноферм мають антитіла до нього. Все це вказує на те, що новий вірус свинячого грипу (його штам отримав назву G4 EA H1N1) може стати причиною нової пандемії.
У 2009-2010 роках сталася пандемія грипу, викликаного вірусом A/H1N1, штамом H1N1pdm2009. Перші випадки захворювання зафіксували в США і Мексиці в квітні 2009, а потім протягом декількох місяців інфекція поширилася по всьому світу. За оцінками Центру з контролю і профілактики захворюваності США, в результаті в перший рік циркуляції вірусу загинуло 151700-575400 осіб.
A/H1N1 виявився особливо заразним і небезпечним, оскільки з'явився в результаті реасортації - змішування генетичного матеріалу декількох вірусів. A/H1N1 - «помісь» вірусів грипу, які заражають свиней (тому грип назвали свинячим), птахів і людей. Коли таке відбувається, новий вірус часто отримує здатність інфікувати ті види, які раніше були до нього несприйнятливі. Тому варто вивчати, які віруси вражають тварин, з якими людина часто контактує - сільськогосподарських, домашніх вихованців, тих, хто часто стає здобиччю мисливців, і так далі. Саме їхні патогени з найбільшою ймовірністю через реасортацію стануть і людськими теж.
Тому дослідники з декількох наукових установ Китаю на чолі з Цзіньхуа Лю (Jinhua Liu) з Китайського сільськогосподарського університету перевірили, які віруси грипу циркулювали серед свиней на китайських фермах 10 найбільш «свинячих» провінцій в 2011-2018 роках, і визначили, як змінювалася з роками їх зустрічуваність. Для цього вчені брали мазки з носа у вбитих на м'ясо тварин (29918 проб), а також робили гомогенат з легких свиней з вираженими ознаками респіраторної інфекції (1016 проб). Віруси виявляли полімеразною ланцюговою реакцією: дивилися передусім на гени гемагглютинінів (H у назві вірусу грипу) і нейрамінідаз (N у назві вірусу грипу). Їх послідовності порівнювали з тими, що вже відомі для інших штамів.
Геном одного з 179 знайдених різновидів вірусу, найбільш близької по будові генів H і N до штаму H1N1pdm2009, секвенували повністю. На культурах клітин епітелія трахеї людини перевірили, наскільки легко вона зв'язується з різними версіями сіалоглікопротеїну SAα2,6Gal - однією з ключових молекул для інфікування вірусами грипу. Крім того, автори проаналізували дані імунологічних тестів 338 працівників 15 свиноферм, під час яких у 2016-2018 роках виявляли наявність антитіл до певних штамів вірусів грипу. Їх порівняли з результатами аналогічних тестів 230 осіб, не задіяних у тваринництві.
Виявилося, що в 2016 році серед китайських свиней почав швидко поширюватися новий штам вірусу грипу H1N1, який автори назвали G4 EA H1N1, і з тих пір він зустрічається частіше за інших. Очевидно, G4 EA H1N1 з'явився в результаті реасортації євразійських і американських штамів A/H1N1. В експериментах з культурами клітин він переважно зв'язувався з «людською» версією сіалоглікопротеїну SAα2,6Gal. Додаткова серія дослідів на тхорах (цих тварин дуже часто використовують для оцінки вакцин і ліків проти грипу) показала, що G4 EA H1N1 легко передається від однієї тварини іншій.
У працівників свиноферм антитіла до вірусу виявили в 10,4 відсотках випадків, у людей, не пов'язаних із сільським господарством, у 4,4 відсотках випадків. Ефект зберігся і після того, як врахували можливу крос-реактивність з H1N1pdm2009 (тобто варіант, коли антитіла були до штаму, що викликав пандемію в 2009, а не до нового вірусу). Все це (близькість до людини, велика частка людей з антитілами до штаму, легкість його пов'язування з потрібним глікопротеїном і передачі від однієї особини до іншої) вказує на те, що G4 EA H1N1 може в найближчі роки стати причиною нової пандемії. Тому автори вказують на необхідність якомога швидше почати періодичні перевірки працівників свиноферм, так само як і самих свиней, на інфекції, пов'язані з вірусами грипу.
У 2016 році американські вчені з'ясували, що тяжкість протікання грипу, викликаного певним штамом вірусу, можна оцінити за рік народження пацієнта. Вона залежить від того, з якими різновидами вірусу людина стикалася в дитинстві, а таку інформацію можна отримати, знаючи їх поширеність в конкретному сезоні. У вірусів грипу всередині однієї групи схожі глікопротеїни нейрамінідази, і якщо імунна система вже колись стикалася з нейрамінідазами конкретної групи, їй, швидше за все, буде простіше дати відсіч вірусам з глікопротеїнами з тієї ж групи.