Італійські та американські біологи розробили алгоритм, за допомогою якого проаналізували людський протеом і знайшли в ньому 2603 білки, що володіють характеристиками антимікробних пептидів. Потім вчені синтезували 55 з них, і виявилося, що більше половини з досліджених пептидів дійсно володіють антимікробною активністю. Робота опублікована в.
Більшість антибіотиків, які зараз використовують, відкрили десятиліття тому. За цей час бактерії встигли втратити до них чутливість. Так, за даними ВООЗ, резистентність до ципрофлоксацину, яким лікують інфекції сечовевидних шляхів і пневмонію, у багатьох країнах досягла 92,9 відсотка, а у - 79,4 відсотка.
Перспективний шлях отримання антибіотиків - пошук нових з'єднань серед антимікробних пептидів, які виробляють всі живі організми для захисту від патогенів. Людина тут не є винятком, тому вчені з Італії та США на чолі з Сесаром де ла Фуенте-Нуньєсом (Cesar de la Fuente-Nunez) з Університету Пенсільванії вирішили пошукати речовини, що володіють протиміробною активністю, в людському організмі. Для цього вони сканували людський протеом - тобто всі білки, вироблені людьми. Дослідники розробили скрипт Python, який шукав білки з характеристиками антимікробних пептидів: довжина від 8 до 50 амінокислотних залишків, позитивний заряд, а також як гідрофобні, так і гідрофільні складові.
Пошук виявив 2603 антимікробних пептида. Виявилося, що вони не мають відношення до імунної системи організму. Вчені вибрали 55 пептидів і синтезували їх в лабораторії, щоб перевірити їхні антимікробні властивості на патогенах, що часто зустрічаються в клінічній практиці -,,, і.
63,6 відсотка досліджених пептидів повністю вбивали хоча б один з видів бактерій в колонії розміром 106 клітин на мілілітр. Цікаво, що якщо вчені комбінували кілька антимікробних пептидів, які вироблялися клітинами певної тканини людського організму, то їх активність збільшувалася. Наприклад, комбінація антимікробних пептидів SCUB1-SKE25 і SCUB3-MLP22 з плазми крові виявилася більш ефективною проти і у мишей з шкірним абсцессомчем ці пептиди окремо (p < 0,0001).
Дослідники вважають, що аналіз протеома людини може допомогти знайти не тільки нові антимікробні препарати, а й ліки від інших хвороб серед білків, які виробляє людський організм.
У матеріалі «Кінець прекрасної епохи» ми розповідаємо, чому антибіотики перестали боротися з інфекціями і чи є їм альтернатива.